Bioinfo-fr.net
@bioinfofr.mamot.fr.ap.brid.gy
Le blog collaboratif de la bioinformatique en langue française ! Astuces, formations, découvertes,... vous attendent sur https://bioinfo-fr.net [bridged from https://mamot.fr/@BioinfoFr on the fediverse by https://fed.brid.gy/ ]
📢 Les parties 2 et 3 de notre série « IA et analyse des génomes : une autre révolution en cours ? » sont désormais disponibles sur Bioinfo-fr ! Toutes nos excuses pour le retard de cette annonce. Merci à Gaëlle Lelandais et Anakim Gualdoni pour cette excellente série d'articles sur l'IA […]
Original post on mamot.fr
mamot.fr
📰 Un nouvel article par Gaëlle Lelandais et son étudiante a été publié sur le blog ! C'est le premier d'une série de 3 sur un modèle de réseau de neurone pour l'analyse des génomes 🧠 https://bioinfo-fr.net/ia-et-analyse-des-genomes-une-autre-revolution-en-cours-partie-1 #bioinfofr #AI […]
Original post on mamot.fr
mamot.fr
📝 Un nouveau p'tit sondage est en ligne sur le blog ! N'hésitez pas à nous proposer vos idées pour les suivants 💡 https://bioinfo-fr.net/les-ptits-sondages #bioinfofr #poll #sondage
Les p'tits sondages - Bioinfo-fr.net
bioinfo-fr.net
📝 Et retrouver un nouveau p'tit sondage sur notre page d'accueil 🤓 https://bioinfo-fr.net/
Bioinfo-fr.net
- Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012 -
bioinfo-fr.net
🗞️ Qu'on adhère ou non, l'usage des IA dans notre travail ne laisse personne indifférent 🤔 @evoluscope nous donne son opinion sur le "vibe coding" : https://bioinfo-fr.net/le-vibe-coding-est-un-piege #IA #bioinfo #bioinfofr #opinion
Le « vibe coding » est un piège - Bioinfo-fr.net
Aujourd'hui, je change un peu de registre : pour une fois je ne vais pas vous expliquer un concept technique mais partager mon avis sur un sujet qui me tient à cœur. Inutile de ménager le suspense, le titre est assez transparent. Pour ceux qui ne connaitraient pas, le « vibe coding » (qu'on peut franciser en « programmation […]
bioinfo-fr.net
📝 Et pour finir, on relance les p'tits sondages ! ✔️ C'est toujours aussi inutile, mais c'est pour ça ce c'est indispensable 😜 N'hésitez pas à retourner sur la page de temps en temps, on essaye de publier une question par semaine 🗓️ https://bioinfo-fr.net/les-ptits-sondages #bioinfofr #stem #poll
Les p'tits sondages - Bioinfo-fr.net
bioinfo-fr.net
📰 Et cette semaine, on change de level en analyse génétique 🧬 avec les pangénomes ↪️ 🔃 🔄 🤔 https://bioinfo-fr.net/graphe-de-pangenome-fin-genome-lineaire #bioinfofr #stem #genome_analysis
Graphe de pangénome : la fin du génome de référence linéaire
Fini le génome de référence linéaire ! Découvrez comment le graphe de pangénome révolutionne la bio-informatique et résout le biais de la référence.
bioinfo-fr.net
📣 Le blog se réveille après une trop longue hibernation 😪 La semaine dernière l'amis Mathurin nous a fait part de la façon dont il a vécu le passage du monde académique 🎓 au monde de l'entreprise 🏢 Une délicate étape qui concerne bon nombre d'entre nous 👀 […]
Original post on mamot.fr
mamot.fr
📣 Le groupe MERIT et la SFBI ont lancé un sondage sur les conditions de travail des bioinfo : https://framaforms.org/enquete-merit-sfbi-sur-les-conditions-de-travail-des-bioinformaticiensnes-1760512193 #sondage #bioinformatique
Enquête MERIT / SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticiens.nes | Framaforms.org
framaforms.org
Bioinfo-fr prend un peu d'avance pour vous souhaitez à tous une bonne rentrée ! 🤓 🎓 Pas de folies prévu de notre côté, nos admins sont dans la choucroute et ne pourront pas être au taquet pour vous concocter une rentrée digne de nom 🙄 . Toutes nos excuses... Mais ce n'est que partie remise ! […]
Original post on mamot.fr
mamot.fr
Hey, regardez qui vient de débarquer sur Mastodon : c'est @sfbi ! Aller hop hop hop ! On s'abonne !
📰 Cette semaine, on vous présente la nouvellle mouture de la licence bioinformatique de Lyon1 : https://bioinfo-fr.net/licence-bio-informatique-statistique-et-modelisation-bism-a-lyon-1 #bioinfofr #formation #Lyon1
Licence Bio-Informatique, Statistique et Modélisation (BISM) à Lyon 1 - Bioinfo-fr.net
Cet article est une mise à jour de https://bioinfo-fr.net/presentation-de-la-licence-miv-a-lyon-1. Cette formation pluridisciplinaire existe depuis 2010 (ex. Modélisation et Informatique du Vivant), et bénéficie de la recherche historique lyonnaise en analyses de données biologiques et notamment en biométrie et statistiques. Les aspects liés à la bioinformatique ont été renforcés à partir de 2018, en lien avec […]
bioinfo-fr.net
📰 Aujourd'hui @evoluscope.bsky.social vous présente l'algorithme d'alignement de séquence de Needleman-Wunsch 🤓 https://bioinfo-fr.net/alignement-needleman-wunsch #bioinfofr #sequence #algorithme
Alignement de séquences : bien comprendre l'incontournable algorithme de Needleman-Wunsch - Bioinfo-fr.net
Dans ce guide détaillé découvrez comment aligner pas à pas deux séquences grâce à l'algorithme de Needleman-Wunsch.
bioinfo-fr.net
📰 Introduction à la chémoinformatique : pour tout comprendre sur les bases de données de molécules et d'ingrédients 🧪 ⚗️ 👩🔬 https://bioinfo-fr.net/des-molecules-et-des-donnees #bioinfofr #chemoinformatics
Des molécules et des données ! - Bioinfo-fr.net
Vu que nous sommes sur un blog de bio-informatique, je vous propose aujourd'hui de parler chimie ! Enfin plutôt, chémoinformatique* et quelques notions de la façon dont une molécule est stockée en ligne en fonction des réglementations chimiques et cosmétiques. Je ne suis pas un expert de ce domaine, mais alors vraiment pas du tout. Par […]
bioinfo-fr.net
📰 @pierrepo , ambassadeur pour @swheritage nous présente l’archive universelle dédiée à la collecte, la préservation et le partage des codes sources logiciels 🖥️ 🔓 ♾️ https://bioinfo-fr.net/software-heritage-larchive-universelle-des-codes-sources-logiciels #softwareheritage […]
Original post on mamot.fr
mamot.fr
📰 Vous n'avez rien compris au changement de licence Anaconda ? 🐍 On vous explique pourquoi et comment se mettre en règle : https://bioinfo-fr.net/conda-et-le-piege-de-la-licence-anaconda #bioinfofr #anaconda #conda
Conda et le piège de la licence Anaconda - Bioinfo-fr.net
Conda est apparu en 2012 et a été distribué par Continuum Analytics, connue sous le nom d’Anaconda Inc depuis 2017. Conda est distribué sous la licence MIT, l’une des licences open-source les plus permissives, permettant aux utilisateurs d’adopter, d’adapter et de partager le logiciel presque sans restrictions. Conda a été conçu pour gérer les environnements […]
bioinfo-fr.net
📝 Le p'tit sondage de la semaine ! Quel bioinformaticien êtes-vous ? https://bioinfo-fr.net/les-ptits-sondages Référez-vous à cet article pour répondre 😜 https://bioinfo-fr.net/quel-bioinformaticien-etes-vous #bioinfofr #sondage
Les p'tits sondages - Bioinfo-fr.net
bioinfo-fr.net
📰 Nos membres ont du talent 🤗 Aujourd'hui, Nico nous présente la base de données de séquences d'anticorps 🌐 développée par son équipe à l'institut Pasteur 👨🔬 "Une base de donnée pour les apparier tous" ! 💍 […]
Original post on mamot.fr
mamot.fr
📰 Aujourd'hui, Gwenaelle nous partage l'histoire des technologies de transcriptomique : comment faisait-on avant l'ère bénie du séquençage haut débit 🤔 https://bioinfo-fr.net/expression-de-gene-evolution #bioinfofr #transcriptomics
Comment l'étude des intensités d'expression de gène a évolué avec les technologies de transcriptomique ? - Bioinfo-fr.net
Cet article est en partie basé sur mon introduction de thèse [0], reformatée pour convenir au format du blog et agrémentée des nouvelles informations pour ne pas être un simple catalogue de connaissances. Qu'il s'agisse du génome entier, du génome de tissus ou du génome de cellules spécifiques, l'étude de la quantité de transcrits produits, […]
bioinfo-fr.net
Cette semaine, nous nous sommes exprimés sur notre choix de plateforme de communication : créer un compte Bluesky ou non. https://bioinfo-fr.net/bioinfo-fr-vous-souhaite-la-bonne-annee-2025 Nous avons choisi de tester l'option bridge avec Bridgy Fed : https://fed.brid.gy/
Édito : Bioinfo-fr vous souhaite la bonne année 2025 - Bioinfo-fr.net
Chers lecteurs, chères lectrices, la nouvelle année commence, et vous avez peut-être (ou pas) pris de bonnes résolutions. La nôtre est de vous offrir la meilleure plateforme de communication possible autours de la bioinfo. Bioinfo-fr existe pour vous, et vie grâce à vous, et nous vous en sommes profondément reconnaissants. Nous essayons de vous fournir […]
bioinfo-fr.net
📝 Le p'tit sondage de la semaine ! Quel éditeur utilisez-vous le plus pour programmer ? ⌨️ 🤓 https://bioinfo-fr.net/les-ptits-sondages Retrouver les résultats des sondages précédents à cette adresse : https://bioinfo-fr.net/sondages #bioinfofr #sondage
Les p'tits sondages - Bioinfo-fr.net
bioinfo-fr.net
📰 Toute l'équipe de Bioinfo-fr vous souhaite une bonne année 2025 🎆 À cette occasion, nous avons rédigé un édito faisant le bilan de l'année écoulée et les défis qui nous attendent cette année 💪 Bonne lecture 🤓 https://bioinfo-fr.net/bioinfo-fr-vous-souhaite-la-bonne-annee-2025 #bioinfofr […]
Original post on mamot.fr
mamot.fr
📰 Aujourd'hui, on vous racconte comment soumettre des données de séquençage à la plateforme GEO : https://bioinfo-fr.net/chronique-dune-soumission-de-donnees-a-geo #bioinfofr #data #ngs #ncbi
Chronique d'une soumission de données à GEO - Bioinfo-fr.net
Je vais vous raconter étape par étape ma soumission de données de séquençage à la base de données de génomique GEO (Gene Expression Omnibus) d'un projet en cours de finition. Sommaire GEO, Qu'est-ce que c'est ? Lorsque l'on veut publier les résultats d'une étude comprenant du séquençage haut débit, nous devons publier les données brutes et […]
bioinfo-fr.net