bonohu
@bonohu.bsky.social
bonohu a researcher in Genomics and Bioinformatics lived on an isolated island on land.
「バイオDX産学共創拠点は、2026年8月20日に開催された『広島中央サイエンスパーク夏休みオープンラボ！』で、ゲノム編集やバイオDXについて知っていただく企画を行いました」 www.jst.biodx.org/post/2026-08...
広島中央サイエンスパーク 夏休みオープンラボ！(施設公開)に参加しました：2026-08-25
バイオDX産学共創拠点は、2026年8月20日に開催された「広島中央サイエンスパーク夏休みオープンラボ！」で、ゲノム編集やバイオDXについて知っていただく企画を行いました。今回は、「シン・ゲノム探偵～DNA暗号を見つけてカットせよ！～」と題して、DNAの中のターゲット配列を探し出してカットする、カットされた配列がどこか発見するなど、探偵ミッション形式でゲノム編集の仕組みを体験していただきました。参...
jst.biodx.org
第475回CBI学会講演会「AI時代における計算科学者の立ち位置 ～研究・教育・現場はどう変わり、私たちは何を学ぶべきか～」 cbi-society.org/home/documen... にて話します。 「AIを活用した公共データベースのメタ解析」 坊農 秀雅（広島大学大学院統合生命科学研究科）
第475回CBI学会講演会「AI時代における計算科学者の立ち位置 ～研究・教育・現場はどう変わり、私たちは何を学ぶべきか～」
cbi-society.org
ぼうのブログ復活！ ブログの更新ができなくなってしまっていたのはコンテンツがないのではなくて… （中略） そういうわけでぼうのブログを研究室のウェブサイト以下に復活させた。 再び情報発信に取り組んでいきたいと思います、よろしくお願いします。 bonohu.hiroshima-u.ac.jp/blog/bonohu-...
寄ってきんさい「えっ、ココ空港だよね！？」広島空港に“怪空間”が突如出現！ 「まだ終わらない」怒涛のリニューアルがスゴい | 乗りものニュース trafficnews.jp/post/694396
「えっ、ココ空港だよね！？」広島空港に“怪空間”が突如出現！ 「まだ終わらない」怒涛のリニューアルがスゴい | 乗りものニュース
広島空港の商業エリアがリニューアル。もみじ饅頭の有名店が集結し、お土産選びがさらに楽しく便利になります。
trafficnews.jp
PlantMetWiki: a FAIR knowledge graph for plant metabolic pathway cross-species representation and integration https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.22.733699v1
学際データ科学（バイオインフォマティックス，ケモインフォマティックス，計算経済学・金融工学，スポーツアナリティクスなど，データ科学・情報科学を基盤として多様な分野と融合する研究分野） ／ 教授、准教授又は助教【応募締切：2026年8月31日（月）23:59（日本標準時）（必着）】 www.hiroshima-u.ac.jp/employment/k...
先進理工系科学研究科
hiroshima-u.ac.jp
Reinventing perilla: Genome editing boosts a traditional herb’s potential | EurekAlert! www.eurekalert.org/news-release...
Reinventing perilla: Genome editing boosts a traditional herb’s potential
Researchers used CRISPR-Cas9 to edit a single gene in red perilla, turning its leaves green and boosting levels of health-promoting compounds. The edited plants accumulated about six times more luteol...
eurekalert.org
【プレスリリース】遺伝子をピンポイントで編集できる技術により高機能なシソの開発に成功 ─シソの遺伝子の働きをピンポイントに抑えることで、健康成分「ルテオリン」が大幅アップ─ research-er.jp/articles/vie... アカシソが見た目「青」シソに
bonohu@bonohu.bsky.social · 2mo ago日本ゲノム編集学会第11回大会で京都大学に。 そのタイミングでアカシソの赤い色素の合成パスウェイの酵素遺伝子をゲノム編集することで赤くならなくなったことを報告する論文がpublished! doi.org/10.3389/fpls...
日本ゲノム編集学会第11回大会で京都大学に。 そのタイミングでアカシソの赤い色素の合成パスウェイの酵素遺伝子をゲノム編集することで赤くならなくなったことを報告する論文がpublished! doi.org/10.3389/fpls...
Frontiers | CRISPR-Cas9 disruption of flavanone 3-hydroxylase produces a green phenotype and alters flavone metabolites in allotetraploid perilla
Perilla frutescens var. crispa is a high-value horticultural crop known for its diverse bioactive metabolites, yet the molecular basis underlying its metabol...
doi.org
【プレスリリース】セイヨウミツバチの成長を促す遺伝子の発現を調節する仕組みを発見 ― 幼虫から蛹への変態で働く“DNA上のスイッチ”を特定 ― research-er.jp/articles/vie...
Transcriptome-based genome-wide analysis reveals hybridization dynamics and genetic structure of Japanese giant salamanders https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.26.727823v1
My poster presentation today! "AI-based Meta-Analysis of Omics Data from Public Databases" #70 at 90th Cold Spring Harbor Laboratory Symposium on Quantitative Biology AI in Biology #cshlsymp26
【プレスリリース】真菌の遺伝子機能注釈を向上させる新手法を開発 ― シイタケおよびダイズさび病菌を例に ― research-er.jp/articles/vie...
【プレスリリース】真菌の遺伝子機能注釈を向上させる新手法を開発 ― シイタケおよびダイズさび病菌を例に ― | 日本の研究.com
2026.04.02 広島大学 プレスリリース 【本研究成果のポイント】真菌(病原菌やキノコ、酵母などが含まれる)で実際に発現している遺伝子の機能を解析する新しい手法を開発し、従来より多くの遺伝子の働きを明らかにできることを確認した。ゲノム編集(※1)標的探索など、バイオテクノロジー応用への活用が期...
research-er.jp
「研究者がビジネスを学ぶことは、研究から離れることではなく、研究の届け先を広げることでもある」 研究者にとって「起業」はどんな選択肢になるのか：TokyoTCPセミナーレポート（第１回） magazine.tayo.jp/2026/03/18/%...
研究者にとって「起業」はどんな選択肢になるのか：TokyoTCPセミナーレポート（第１回） | tayo magazine
magazine.tayo.jp
アレルギー低減卵のインタビュー動画が公開されています。 youtu.be/heBp0stMuEY 卵アレルギーの人たちが食べられる 「アレルギー低減卵」の研究開発が ゲノム編集技術を利用して進められています。 その内容を分かりやすく紹介するため、 インタビュー形式の動画を制作しました。 開発の経緯、実用化への取り組み、 食品としての安全性の確保、国内外での反応、 今後の展望などについて、 研究者たちが語っています。 ぜひご覧ください。
卵アレルギーでも食べられる卵の社会実装に向けて
YouTube video by バイオステーション
youtu.be
Supporting Metadata Curation from Public Life Science Databases Using Open-Weight Large Language Models https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.02.16.706241v1
🌾 Now published in Bioinformatics Advances: "Functional annotation of novel heat stress-responsive genes in rice utilizing public transcriptomes and structurome". Explore the full study: https://doi.org/10.1093/bioadv/vbag013 Authors include: @sorayone56.bsky.social
大学院生時代からやりたかった「配列類似性は低いが、構造類似性は高い」に基づく遺伝子機能予測手法の開発。 特定生物のゲノム(genome)解読による遺伝子コード領域予測とそこから得られるすべてのタンパク質配列情報(proteome)、さらにAlphafoldによるそれらすべてのタンパク質の立体構造情報(structurome)、そして高速なタンパク質立体構造比較が可能となったことで、それをついに実現することができました！
bonohu@bonohu.bsky.social · 7mo agoFollowing peer review, a research paper titled "Functional annotation of novel heat stress-responsive genes in rice utilizing public transcriptomes and structurome" was typeset and published! #bonohulab Bioinformatics Advances, Volume 6, Issue 1, 2026, vbag013, doi.org/10.1093/bioa...
Following peer review, a research paper titled "Functional annotation of novel heat stress-responsive genes in rice utilizing public transcriptomes and structurome" was typeset and published! #bonohulab Bioinformatics Advances, Volume 6, Issue 1, 2026, vbag013, doi.org/10.1093/bioa...
Functional annotation of novel heat stress-responsive genes in rice utilizing public transcriptomes and structurome
AbstractMotivation. Life science databases include large collections of public transcriptome and large-scale structural data. The reuse and integration of
doi.org
Following peer review, a research paper titled "Functional Annotation Workflow for Fungal Transcriptomes" was published. doi.org/10.3390/jof1... #bonohulab
doi.org
【CHIBADAI Story】 Open Databases, More Freedom: From Failed Experiments to Data Science Tazro OHTA, Associate Professor Institute for Advanced Academic Research / Graduate School of Medicine, #ChibaUniversity www.cn.chiba-u.jp/en/story_e26... #AI #DataScience #Database #Genome #Research
Open Databases, More Freedom: From Failed Experiments to Data Science Associate Professor, Institute for Advanced Academic Research/Graduate School of Medicine, Chiba University Tazro OHTA | CHIBADAI ...
"My job is to collect and clean data," says Associate Professor Tazro Ohta of Chiba University's Institute for Advanced Academic Research, Graduate School of Medicine, and Data Science Core (DSC). As ...
cn.chiba-u.jp
