Widespread immune systems protect bacteria against conjugative plasmids

Conjugative plasmids are a class of mobile genetic elements capable of efficient transfer between bacterial cells. Although they can introduce beneficial traits such as antibiotic resistance to recipi...

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Antibiotics stimulate protein transfer to persister cells

The exchange of biological matter between bacterial cells drives adaptation and evolution. However, whether bacteria can exchange functional proteins remains unclear. In this work, we found that antib...

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PNAS

Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), a peer reviewed journal of the National Academy of Sciences (NAS) - an authoritative source of high-impact, original research that broadly spans...

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Eco-evolutionary responses to plasmid-dependent phage constrain the spread of multidrug-resistance plasmids

Abstract. Phage therapy offers an alternative to antibiotics for treating multidrug-resistant infections. Plasmid-dependent phages (PDPs) are promising the

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A bacterial CARD–NLR-like immune system controls the release of gene transfer agents - Nature Microbiology

An immunity-like system functions as a lysis control hub to promote gene transfer agent particle release from host bacterial cells, suggesting that bacterial immune systems may be co-opted to promote ...

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Mechanistic insights into plasmid transfer inhibition in Enterobacterales by nucleoside analogues - npj Antimicrobials and Resistance

npj Antimicrobials and Resistance - Mechanistic insights into plasmid transfer inhibition in Enterobacterales by nucleoside analogues

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Plasmids promote antimicrobial resistance through insertion sequence-mediated gene inactivation - Nature Microbiology

Inactivation of chromosomal genes through plasmid-encoded IS elements is an extended mechanism of antimicrobial resistance evolution in bacteria.

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Postdoctoral researcher in molecular and cellular bacteriology - ERC CoG VAMPIRE

The research group of Prof Géraldine Laloux at the de Duve Institute (UCLouvain) is looking for a highly motivated postdoc to elucidate the molecular factors underlying bacterial prey-predator interac...

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Type IV secretion systems: reconciling diversity through a unified nomenclature

This review presents a comprehensive overview of Type IV Secretion Systems (T4SSs), focusing on their structural, functional, and evolutionary diversity ac

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Ingénieur-e en biochimie des protéines

IE26-MICA-1 - Vous rejoindrez l'unité mixte de recherche DynAMic, qui rassemble des chercheur-es, enseignant-es-chercheur-es et personnels d'appui autour de l'étude des mécanismes d'évolution rapide des bactéries. Les travaux de l'unité portent sur le transfert de l'information génétique, son intégration dans le génome bactérien et les mécanismes de régulation associés, avec des enjeux forts en lien avec la dissémination de la résistance aux antibiotiques.Vous serez accueilli-e au sein de l'équipe ICE-TeA, qui s'intéresse plus particulièrement aux mécanismes moléculaires du transfert horizontal de gènes, et interviendrez également en appui des activités de l'équipe StrAda, dédiée à l'étude des mécanismes de recombinaison. Votre environnement de travail est fortement collaboratif, avec des interactions étroites avec des équipes locales spécialisées en cristallographie, en résonance magnétique nucléaire et autres techniques d'analyse, ainsi qu'avec une plateforme technologique disposant d'équipements de pointe pour l'étude des interactions moléculaires.Dans ce contexte scientifique exigeant, votre poste occupe une place centrale pour le développement des projets de recherche de l'unité. Vous piloterez les activités de production, d'analyse et de caractérisation des protéines, contribuerez à la structuration des approches expérimentales et jouerez un rôle clé dans la transmission des savoir-faire, la qualité des données produites et le bon fonctionnement des équipements. Vous contribuerez au bon développement des différents projets (planification, gestion des ressources, etc) et assurerez des missions de formation et d'encadrement). Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :Production, purification et analyse des protéines :-Choisir, développer et adapter les protocoles de production et de purification de protéines recombinantes-Mettre en oeuvre et optimiser des techniques de biochimie et de biologie moléculaire (production de protéines hétérologues, électrophorèse, clonage, séquençage, PCR, purification protéines)-Conduire les analyses fonctionnelles et structurales des protéines en lien avec les projets de recherchePilotage technique, qualité et équipements :-Organiser et gérer les moyens techniques nécessaires aux projets scientifiques-Assurer le fonctionnement, le suivi métrologique et la maintenance des équipements-Mettre en oeuvre une démarche qualité et garantir la traçabilité et la fiabilité des résultats-Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine de la biochimie des protéinesFormation, encadrement et animation scientifique :-Former et accompagner les membres de l'unité aux techniques de production et d'analyse des protéines-Apporter un appui méthodologique et technique aux projets de recherche-Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations et de publications-Contribuer au respect des règles d'hygiène et de sécurité au laboratoire

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PlasAnn: a curated plasmid-specific database and annotation pipeline for standardized gene and function analysis

Abstract. Conjugative plasmids are key drivers of bacterial adaptation, enabling the horizontal transfer of accessory genes within and across diverse micro

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Two D-loop resolution systems enable natural genetic transformation in bacteria

Natural transformation is a widespread mechanism driving genetic exchanges in bacteria. It proceeds by the capture and internalization of exogenous DNA in linear single strands, ultimately integrated in the genome by homologous recombination. It is unknown how the RecA-directed D-loop intermediate of this dedicated recombination pathway is processed. We report that resolution of the transformation D-loop depends on two endonucleases of opposing phylogenetic distribution in bacteria. One is YraN, which has co-evolved and interacts with the ComM helicase, known to extend DNA recombination at the transformation D-loop. The other is CoiA, which is restricted to the Bacillota. CoiA is shown to be a resolvase of the transformation D-loop, extended by the RadA helicase in these species. We demonstrate that both YraN and CoiA act synergistically with their cognate helicases. These findings reveal that bacteria have evolved two helicase/nuclease pairs for the maturation and recombination extension of the transformation D-loop. ### Competing Interest Statement The authors have declared no competing interest. Agence Nationale de la Recherche, https://ror.org/00rbzpz17, ANR-20-CE12-0004, ANR-10-BLAN-1331, ANR-17-CE13-0031, ANR-22-CE44-0044, ANR-10-LABX-62-IBEID, PIA/ANR-16-CONV-0005 Fondation pour la Recherche Médicale, https://ror.org/04w6kn183, FDT202001010890 European Union's Horizon research and innovation programme. Marie Skłodowska-Curie Postdoctoral Fellowships, 101208987 National Institute of Health, USA, R35GM128674

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