Badreddine Douzi
@badreddinedouzi.bsky.social
INRAe Researcher Scientist @ Nancy Having fun to use microbiology, structural biology and biochemistry to understand mechanisms underlying proteins and DNA transport across bacterial envelope.
Un poste de MCF (👇) s'ouvre dans notre unité MMSB, avec possibilité d'accueil dans mon équipe Venez travailler avec nous sur les mécanismes moléculaires impliqués dans la réponse au stress et la modulation de la croissance chez les bactéries! N'hésitez pas à me contacter si vous êtes intéressés!
MMSB-Lyon@mmsb-lyon.bsky.social · 6mo ago📢 Recrutement d’un(e) Maître(sses) de conférence en Biochimie générale, spécialité bactériologie moléculaire à MMSB 🔬Recherche *Immunité anti-phages *Réponse au stress, modulation de la croissance bactérienne ✉️ christophe.grangeasse@cnrs.fr 📚Enseignement : Université Lyon I ✉️ patrice.gouet@ibcp.fr
Ingénieur-e d'étude en biochimie des protéines en concours externes INRAE. Si vous êtes passionnés par les biochimie des protéines et souhaitez rejoindre un environnement dynamique, n'hésitez pas à postuler (Clôture des inscriptions : 19 Mars) jobs.inrae.fr/concours/con...
Ingénieur-e en biochimie des protéines
IE26-MICA-1 - Vous rejoindrez l'unité mixte de recherche DynAMic, qui rassemble des chercheur-es, enseignant-es-chercheur-es et personnels d'appui autour de l'étude des mécanismes d'évolution rapide des bactéries. Les travaux de l'unité portent sur le transfert de l'information génétique, son intégration dans le génome bactérien et les mécanismes de régulation associés, avec des enjeux forts en lien avec la dissémination de la résistance aux antibiotiques.Vous serez accueilli-e au sein de l'équipe ICE-TeA, qui s'intéresse plus particulièrement aux mécanismes moléculaires du transfert horizontal de gènes, et interviendrez également en appui des activités de l'équipe StrAda, dédiée à l'étude des mécanismes de recombinaison. Votre environnement de travail est fortement collaboratif, avec des interactions étroites avec des équipes locales spécialisées en cristallographie, en résonance magnétique nucléaire et autres techniques d'analyse, ainsi qu'avec une plateforme technologique disposant d'équipements de pointe pour l'étude des interactions moléculaires.Dans ce contexte scientifique exigeant, votre poste occupe une place centrale pour le développement des projets de recherche de l'unité. Vous piloterez les activités de production, d'analyse et de caractérisation des protéines, contribuerez à la structuration des approches expérimentales et jouerez un rôle clé dans la transmission des savoir-faire, la qualité des données produites et le bon fonctionnement des équipements. Vous contribuerez au bon développement des différents projets (planification, gestion des ressources, etc) et assurerez des missions de formation et d'encadrement). Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :Production, purification et analyse des protéines :-Choisir, développer et adapter les protocoles de production et de purification de protéines recombinantes-Mettre en oeuvre et optimiser des techniques de biochimie et de biologie moléculaire (production de protéines hétérologues, électrophorèse, clonage, séquençage, PCR, purification protéines)-Conduire les analyses fonctionnelles et structurales des protéines en lien avec les projets de recherchePilotage technique, qualité et équipements :-Organiser et gérer les moyens techniques nécessaires aux projets scientifiques-Assurer le fonctionnement, le suivi métrologique et la maintenance des équipements-Mettre en oeuvre une démarche qualité et garantir la traçabilité et la fiabilité des résultats-Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine de la biochimie des protéinesFormation, encadrement et animation scientifique :-Former et accompagner les membres de l'unité aux techniques de production et d'analyse des protéines-Apporter un appui méthodologique et technique aux projets de recherche-Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations et de publications-Contribuer au respect des règles d'hygiène et de sécurité au laboratoire
jobs.inrae.fr
Happy to share a new review proposing a unified nomenclature for T4SSs. Great collaboration with Peter J Christie, Gabriel Waksman, Ronnie Per-Arne Berntsson and our team. academic.oup.com/femsre/artic... #T4SS#Microbiology
Type IV secretion systems: reconciling diversity through a unified nomenclature
This review presents a comprehensive overview of Type IV Secretion Systems (T4SSs), focusing on their structural, functional, and evolutionary diversity ac
academic.oup.com
Coup de projecteur sur des projets en rupture et à haut risque du programme EXPLOR’AE ✔️39 idées exploration et 5 projets transformation déjà financés #France2030 Des hypothèses originales pour des innovations de rupture, des recherches qui sortent des sentiers battus ! url.inrae.fr/44ySyng
EXPLOR’AE : INRAE dévoile des projets de recherche en rupture et à haut risque
DOSSIER DE PRESSE - Le programme France 2030 « Accélération de la recherche à risque en Agriculture, Alimentation et Environnement » EXPLOR’AE offre un cadre inédit pour soutenir des projets de recher...
url.inrae.fr
#AMR Nice summary of the new hope www.thevermilion.com/why-could-a-...
Why could a new class of antibiotics really make a difference?
The discovery of penicillin dates back to 1928. And since then, antibiotics have contributed to saving millions of lives all over the world, extending the average duration of human life by 23 years. I...
thevermilion.com
New antibiotic class discovered by researchers at @mcmasteruniversity.bsky.social & @illinoispress.bsky.social "A broad-spectrum lasso peptide antibiotic targeting the bacterial ribosome" in @nature.com Hope it can make it to market to help combat #AMR infections www.nature.com/articles/s41...
A broad-spectrum lasso peptide antibiotic targeting the bacterial ribosome - Nature
A new lasso peptide antibiotic exhibits broad-spectrum activity against Gram-negative and Gram-positive bacteria by interfering with bacterial protein synthesis, is unaffected by common resistanc...
nature.com
We are looking for a postdoc! Join us to work in an exciting integrated structural biology project, focusing on understanding how Type 4 Secretion System facilitate horizontal gene transfer in bacteria! Please share! www.nature.com/naturecareer...
Postdoctoral position to study Gram-positive Type 4 Secretion Systems - Umeå, Sweden job with Umeå University | 12837918
A two-year Postdoctoral position for studies of Gram-positive Type 4 Secretion Systems that facilitate the spread of antibiotic resistance
nature.com
www.nature.com/articles/s41... In collaboration with Andrew Lang and Alison Buchan, we just published a review on the complex and sometimes convoluted interactions and evolutionary relationships among bacterial mobile genetic elements. #phage #plasmid #evolution #bacteria #plasmidbiology #MGE
Interactions and evolutionary relationships among bacterial mobile genetic elements - Nature Reviews Microbiology
In this Review, Lang and colleagues present an overview of the current knowledge landscape regarding mobile genetic elements in bacteria, with a focus on their evolutionary relationships and interacti...
nature.com
Exited to start the T4SS conference. www.t4ss-conference-nancy.org
Home - T4SS
t4ss-conference-nancy.org
We organize the french EPR society meeting at the @iecb.bsky.social in Bordeaux. Registration are due soon! More info here : www.a-rpe.fr/spip.php?art...
Journées de l’ARPE 2025 - L’Association française de Résonance Paramagnétique Electronique (ARPE)
Cette année les journées de l'ARPE se délocalisent à Bordeaux ! Les journées de l'ARPE 2025 se délocalisent à Bordeaux, à l'EICB (Institut (…)
a-rpe.fr
Exciting to see our paper now published 🙌 www.science.org/doi/10.1126/... In this project co-led with @ostermanilya.bsky.social at @soreklab.bsky.social , we show that a bacterial immune system employs a TIR protein and a caspase-like protease, two typical immune components seen in eukaryotes. 🧵👇
TIR signaling activates caspase-like immunity in bacteria
Caspase family proteases and Toll/interleukin-1 receptor (TIR)-domain proteins have central roles in innate immunity and regulated cell death in humans. We describe a bacterial immune system comprisin...
science.org
Osterman Ilya@ostermanilya.bsky.social · 2y agoOur paper is finally published in Science! 🎉The HPLC, NMR, MS, purification, and characterization of the new molecule felt like a real detective story. I was especially thrilled to use and reference my grandfather, Lev Osterman's, 1966 paper—he was the main reason I became a scientist.
Exciting stuff! will be interesting to test this on our own favourite protein ensembles!
Frank Noe@franknoe.bsky.social · 2y agoSuper excited to preprint our work on developing a Biomolecular Emulator (BioEmu): Scalable emulation of protein equilibrium ensembles with generative deep learning from @msftresearch.bsky.social ch AI for Science. www.biorxiv.org/content/10.1...
Well, this is silly. Clarivate won’t give @elife.bsky.social an impact factor, citing quality concerns with their model, but happily does so for partially predatory journals like those within MDPI? www.science.org/content/arti...
Open-access journal elife will lose its ‘impact factor’ over controversial publishing model
Web of Science index decides to strip key metric because elife’s unusual peer review doesn’t meet its criteria
science.org
New review from our C. Lesterlin/TacC lab ! 🌟 The potential and limitations of conjugation-based antibacterial strategies. doi.org/10.1111/1751...
Design, potential and limitations of conjugation‐based antibacterial strategies
Highlighting of innovative non-antibiotic strategies, specifically CRISPR-based systems delivered via bacterial conjugation.
doi.org
Re-sharing our last paper on the effect of restriction-modification systems on conjugative plasmids: doi.org/10.1093/nar/... #MicroSky
Various plasmid strategies limit the effect of bacterial restriction–modification systems against conjugation
Abstract. In bacteria, genes conferring antibiotic resistance are mostly carried on conjugative plasmids, mobile genetic elements that spread horizontally
doi.org
And finally, a recent review we wrote speculating on the evolutionary aspects of MGEs mobilising chromosomal DNA
Tatiana Dimitriu@tatianadimitriu.bsky.social · 2y agoNew review paper led by Mick Vos (currently not on social media) Why do mobile genetic elements transfer DNA of their hosts?: Trends in Genetics www.cell.com/trends/genet...
The contribution of natural transformation for the acquisition of novel genes has been notoriously difficult to quantify because it relies on recombination (which is affected by other processes). Here's a first estimate : doi.org/10.1101/2025... (for the very busy: 1-6% of gene gains) #MicroSky
Happy to see this story out! Elucidating assembly and function of VirB8 cell wall subunits refines the DNA translocation model in Gram-positive T4SSs | Science Advances www.science.org/doi/10.1126/... Thanks to all colleagues and collaborators! With support of INRAe, Université de Lorraine and ANR.
Elucidating assembly and function of VirB8 cell wall subunits refines the DNA translocation model in Gram-positive T4SSs
Structure-function exploration of VirB8-like subunits paves the way to better understand T4SSs in Gram-positive bacteria.
science.org
We are very pleased to share our latest preprint on the architecture of the membrane complex of the type 7 secretion system involved in bacterial competition in B. subtilis. #CryoEM #microsky
bioRxiv Microbiology@biorxiv-microbiol.bsky.social · 2y agoA ubiquitin-like protein controls assembly of a bacterial Type VIIb secretion system https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.01.24.634720v1